| 【1998年ファーストステージ順位表】 | ||||||
| 順位 | チーム | 勝点 | 勝ち | 分け | 負け | 得失点 |
| 1 | ジュビロ磐田 | 39 | 13 | 0 | 4 | 34 |
| 2 | 清水エスパルス | 39 | 13 | 0 | 4 | 18 |
| 3 | 名古屋グランパスエイト | 33 | 12 | 0 | 5 | 16 |
| 4 | 横浜マリノス | 32 | 11 | 0 | 6 | 18 |
| 5 | 鹿島アントラーズ | 32 | 11 | 0 | 6 | 13 |
| 6 | ヴェルディ川崎 | 30 | 10 | 0 | 7 | 9 |
| 7 | 浦和レッズ | 28 | 11 | 0 | 6 | 7 |
| 8 | 横浜フリューゲルス | 26 | 10 | 0 | 7 | 1 |
| 9 | セレッソ大阪 | 23 | 8 | 0 | 9 | -11 |
| 10 | 柏レイソル | 22 | 9 | 0 | 8 | -3 |
| 11 | ジェフユナイテッド市原 | 21 | 7 | 0 | 10 | 0 |
| 12 | ベルマーレ平塚 | 20 | 8 | 0 | 9 | -7 |
| 13 | サンフレッチェ広島 | 19 | 7 | 0 | 10 | -11 |
| 14 | ガンバ大阪 | 17 | 7 | 0 | 10 | -2 |
| 15 | 京都パープルサンガ | 16 | 6 | 0 | 11 | -13 |
| 16 | コンサドーレ札幌 | 11 | 4 | 0 | 13 | -16 |
| 17 | ヴィッセル神戸 | 9 | 3 | 0 | 14 | -28 |
| 18 | アビスパ福岡 | 7 | 3 | 0 | 14 | -25 |
| 【1998年セカンドステージ順位表】 | ||||||
| 順位 | チーム | 勝点 | 勝ち | 分け | 負け | 得失点 |
| 1 | 鹿島アントラーズ | 42 | 15 | 0 | 2 | 23 |
| 2 | ジュビロ磐田 | 39 | 13 | 0 | 4 | 34 |
| 3 | 浦和レッズ | 33 | 11 | 0 | 6 | 15 |
| 4 | 横浜マリノス | 32 | 11 | 0 | 6 | 13 |
| 5 | 清水エスパルス | 31 | 12 | 0 | 5 | 18 |
| 6 | 名古屋グランパスエイト | 30 | 11 | 0 | 6 | 8 |
| 7 | 横浜フリューゲルス | 25 | 9 | 0 | 8 | 5 |
| 8 | 柏レイソル | 25 | 9 | 0 | 8 | -2 |
| 9 | サンフレッチェ広島 | 24 | 9 | 0 | 8 | 4 |
| 10 | コンサドーレ札幌 | 24 | 8 | 0 | 9 | -1 |
| 11 | 京都パープルサンガ | 23 | 9 | 0 | 8 | -3 |
| 12 | ベルマーレ平塚 | 22 | 8 | 0 | 9 | -6 |
| 13 | セレッソ大阪 | 21 | 7 | 0 | 10 | -12 |
| 14 | ヴィッセル神戸 | 16 | 6 | 0 | 11 | -16 |
| 15 | アビスパ福岡 | 14 | 5 | 0 | 12 | -27 |
| 16 | ガンバ大阪 | 13 | 5 | 0 | 12 | -12 |
| 17 | ヴェルディ川崎 | 9 | 3 | 0 | 14 | -15 |
| 18 | ジェフユナイテッド市原 | 4 | 2 | 0 | 15 | -26 |
| チャンピオンシップ試合結果 | ||||||
| ジュビロ磐田 H | 1-2 | A | ☆鹿島アントラーズ☆ | |||
| A | 1-0 | H | ||||
| 1998年 年間得点王 | ||||||
| 1 | 中山雅史(ジュビロ磐田) | 36得点 | ||||
| 2 | 城彰二(横浜マリノス) | 25得点 | ||||
| 3 | 柳沢敦(鹿島アントラーズ) | 22得点 | ||||
| 4 | バルデス(コンサドーレ札幌) | 21得点 | ||||
| 4 | オリバ(清水エスパルス) | 21得点 | ||||
| 6 | 呂比須ワグナー(ベルマーレ平塚) | 18得点 | ||||
| 6 | 森島寛晃(セレッソ大阪)) | 18得点 | ||||
| 8 | 藤田俊哉(ジュビロ磐田) | 17得点 | ||||
| 8 | 小島宏美(ガンバ大阪) | 17得点 | ||||
| 8 | 金度勲(ヴィッセル神戸) | 17得点 | ||||